מתחם חצר סרגיי היה נתון במחלוקת בין ממשלות ישראל וברית המועצות ולאחר מכן בין ממשלות ישראל ורוסיה. ממשלת ישראל שיכנה במתחם במשך עשרות שנים את משרד החקלאות ואת משרדי החברה להגנת הטבע. בסרט הישראלי “מישהו לרוץ איתו”, על פי ספרו של דויד גרוסמן, שמשה החצר לצילומים של מקום מגוריה של הנזירה תיאודורה. במהלך שנת  2009 הועברו חלק ממבני המתחם, חלק שהיה בשימוש ממשלת ברית המועצות לפני עשרות שנים, לבעלות ממשלת רוסיה. גם לאחר מכן עדיין שכנו במקום אגפים ממשרד החקלאות הישראלי. רק לקראת ביקורו של נשיא רוסיה, ולדימיר פוטין, בארץ בשנת 2011, הוצאו אגפי משרד החקלאות מהמתחם ומעט לאחר מכן בקיץ 2012 הושלם תהליך מסירת שטח המתחם לממשלת רוסיה. כ-5 שנים היה המקום סגור ועבר תהליך ארוך של שיפוץ. החל משנת 2017 משמש המתחם כבית מלון בבעלות רוסית ומאז הוא פתוח בכל ימות השנה.